Objetivando a articulação entre os conteúdos mínimos de Química exigidos no ensino médio e uma abordagem pedagógica diferenciada destes conteúdos, existem como atividades acadêmicas obrigatórias na matriz do curso de Licenciatura os Núcleos de Ensino, Pesquisa e Extensão (NEPEs I, II, III e IV). Os licenciandos precisam cumprir 30 horas de cada atividade a partir do 5º período (integral) ou 7º período (noturno) sob a orientação do professor do NEPE; apresentando para uma banca composta pelo professor do NEPE e mais dois membros o desenvolvimento, ao final de cada atividade, de um material didático teórico-prático visando a melhoria efetiva do processo de ensino-aprendizagem no ambiente escolar. Ao professor do NEPE cabe incentivar a divulgação deste material didático em revistas acadêmicas, bem como sua apresentação sob a forma de painéis ou oralmente em Jornadas, Encontros, Simpósios ou Congressos; podendo ainda ser apresentado como uma das atividades nos estágios curriculares obrigatórios (400 horas).
Em cada um dos NEPEs há um enfoque num campo da Química relacionado ao cotidiano dos alunos do ensino médio:
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