• Bioecologia dos peixes e qualidade ambiental em praias, baías, estuários e sistemas costeiros semi-fechados;
• Comportamento, ecologia e conservação de cetáceos;
• Ecologia e Conservação e impactos ambientais em peixes de reservatórios neotropicais;
• Interações Bióticas e Fatores Estruturadores em Comunidades de Invertebrados em ambientes aquáticos;
• Organização social e bioacústica do cetáceos;
• Peixes de Recifes Rochosos;
• Taxonomia e ecologia de Polychaeta (Annelida) e fauna associada a substratos consolidados;
• Vazão ecológica e uso de peixes como indicadores de qualidade ambiental em rios e riachos tropicais.
• Anatomia e ultraestrutura de insetos vetores e bioquímica e taxonomia de Tripanosomatídeos
• Bio-ecologia e manejo integrado das moscas hematófagas e dos insetos causadores de miíasis e aplicações em Entomologia Forense
• Biologia e Ecologia das relações formiga-parasitóide
• Biodiversidade de parasitos de peixes de sistemas marinhos costeiros do Rio de Janeiro: diagnóstico morfológico, caracterização molecular e inventário das espécies
• Biologia, morfologia, ultra-estrutura de larvas de helmintos e bioquímica da sua interação com seu hospedeiro intermediário – molusco
• Diagnóstico, biodiversidade e ecologia de parasitos de peixes em águas interiores da região Neotropical: Taxonômia, ecológia, zoonoses e uso potencial como indicador da condição ambiental
• Ecogenética, morfologia e taxonomia de mosquitos vetores das famílias Culicidae (Diptera) e Reduviidae (Hemiptera) no Estado do Rio de Janeiro
• Efeito dos impactos ambientais na biodiversidade de dípteros Calliphoridae em diferentes ecossistemas (Mata Atlântica, rural e urbano)
• Taxonomia e ecologia de coccídios de aves silvestres do sudeste brasileiro
• Biodiversidade e Ecologia de Morcegos: Amostragens de longa duração com morcegos no Sudeste do Brasil
• Biodiversidade e biologia de peixes costeiros e de águas interiores Neotropicais
• Biodiversidade, Ecologia e Distribuição de Vertebrados Terrestres Neotropicais
• Estudo Sistemático e Bionômico dos Quirópteros Neotropicais
• Sistemática, biologia e parasitologia de aves neotropicais
• Sistemática, ecologia e biogeografia de anfíbios anuros neotropicais
• Pesca, dinâmica populacional e ecologia de crustáceos decápodes e carcinofauna acompanhante
• Bioquímica e Fisiologia de Insetos vetores e pragas
• Ecologia de Formigas
• Insetos Aquáticos Neotropicais
• Taxonomia, sistemática e diversidade de Crustacea Peracarida, com ênfase em Isopoda e Amphipoda
• Macro e Microanatomia de Vertebrados
• Histologia e histoquímica de tecidos, órgãos e sistemas vertebrados
• Distribuição topográfica das células endócrinas no sistema gastro-entero-pancreático de vertebrados
• Desenvolvimento Embrionário de Vertebrados
• Análise citogenética e desenvolvimento de marcadores moleculares para identificação de grupos zoológicos