O Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal (PPGBA) foi iniciado em 1995, com o oferecimento simultâneo dos Cursos de Mestrado (credenciado em 1998) e Doutorado (credenciado em 2002). O Programa, enquadrado inicialmente na área de avaliação “Conservação de Grupos Silvestres” da CAPES, recebeu conceito 4 da CAPES para ambos os cursos, atingindo o conceito 5 na avaliação trienal 2007-2009, e mantendo este mesmo conceito até a avaliação de 2013-2016, no qual o curso recebeu nota 4 devido a distribuição da produção científica altamente qualificada (A1 e A2), que embora se manteve quantitativamente suficiente, não foi equitativamente distribuída entre os membros do Núcleo Permanente.

Em 2017, a área de concentração do programa foi alterada para “Biodiversidade Animal”, visando abranger melhor as linhas de pesquisas desenvolvidas e a formação dos egressos do programa. Todas as linhas de pesquisas migraram para esta nova área de concentração a partir de 2018. O programa de Pós-Graduação conta com linhas de formação básica, como Anatomia, Histologia, Imuno-histoquimica, Embriologia e Genética de Vertebrados, até linhas mais aplicadas à gestão da qualidade ambiental, como a Biologia do Parasitismo e Biologia, Ecologia e Sistemática de Artropodes: Insetos e Crustáceos, com enfoque no controle de insetos vetores de doenças. As linhas tradicionais em Biologia, Taxonomia e Ecologia são abrangentes compreendendo os grupos de peixes, anfíbios, aves e mamíferos. Também existem grande interação entre as linhas, com alguns docentes atuando em duas diferentes linhas, aumentando a integração dos docentes e discentes do programa.

O Núcleo Permanente de Docente é composto de 11 professores, além de 5 professores Colaboradores, totalizando 16 professores, todos doutores. O Programa apresenta grande demanda, com mais de 400 mestres e doutores titulados pelo PPGBA. As Dissertações e Teses têm sido publicadas como artigos científicos em periódicos nacionais e internacionais da área de conhecimento. Muitos egressos do PPGBA têm ingressado em outras Universidades, Institutos de Pesquisas e Agências Reguladoras, onde desempenham funções de professores / pesquisadores.

Para a Internacionalização, o PPGBA tem enviado desde 2012 vários alunos Doutorandos em programas “sanduíche” para o exterior, aumentando a interação com laboratórios estrangeiros e se refletindo na crescente melhoria dos trabalhos de Conclusão, visando suas publicações em revistas de reconhecida qualidade cientifica e ampla circulação internacional. Tem sido meta do Programa o estabelecimento de um grupo de elevada qualificação em suas linhas de pesquisas a nível nacional e internacional, com a formação de Mestres e Doutores plenamente qualificados para atuarem no mercado de trabalho.