Qualificação: Validação e Implementação em Nível Nacional de uma Plataforma “On-line” para Identificação Molecular de Carrapatos Brasileiros.
Discente: LUCAS AGUIAR ROSA MACHADO
Orientador: DOUGLAS MCINTOSH
Coorientador: TASSIA TORRES FURTADO
Local: Departamento de Parasitologia Animal
Data: 01/12/2025
Hora: 09:00
Tipo da banca: QUALIFICAÇÃO
Número de páginas: 67
Resumo
Carrapatos e riquétsias são organismos de interesse na saúde humana e animal devido às doenças que transmitem ou causam. O Brasil possui uma rica diversidade de espécies desses organismos e novas espécies continuam a ser encontradas até hoje. Apesar disso, devido ao alto custo do sequenciamento, estudos recentes deixam de identificar todos seus carrapatos a nível de espécie, deixando as larvas a nível de gênero. Enquanto a coinfecção de riquétsias não é um fenômeno bem entendido e difícil de ser observado com primers universais. Métodos baseados em PCR-RFLP para identificação de menor custo de carrapatos e riquétsias foram desenvolvidos anteriormente pelo LBioMol. O presente estudo teve como objetivo facilitar o uso desses métodos; gerar novos perfis de identificação para carrapatos e confirmar a qualidade das sequências usadas para criação e atualização do método para carrapatos. Para isso, foi feito levantamento de sequências de 16S rDNA de Ixodida brasileiros e no caso das sequências de Amblyomma spp., dados de origem e tamanho foram anotados e comparados. Todas as sequências coletadas foram alinhadas a 100% de similaridade para criação de haplótipos e para Amblyomma spp. foram criadas tabelas de variação para comparação. Os haplótipos foram alinhados a 97% de similaridade e usados para criação de consensos, que por sua vez foram usados em filogenia. Perfis de digestão foram gerados para os haplótipos de Ixodida através de digestão in silico. Enquanto em riquétsia os perfis gerados pelo LBioMol foram inseridos em ferramenta online criada com Wix. No total 48,31% das sequências levantadas foram coletadas no Brasil, enquanto as demais sequências foram coletadas em 17 países diferentes ou não tiveram seu local de origem informado. Foram observadas 29 sequências depositadas com a espécie errada e a espécie correta foi identificada através de BLAST. Duas árvores filogenéticas foram montadas e gerou-se ao todo 176 perfis de digestão para 74 espécies de carrapatos encontrados em território nacional e uma chave dicotômica foi criada para facilitar a identificação destas espécies. A ferramenta online criada para Rickettsia spp. suporta a identificação de espécies e cepas encontradas em território nacional com diferentes alvos moleculares. Palavras-chave: PCR-RFLP, Ixodida, Rickettsia.
Palavras-chave
PCR-RFLP, Ixodida, Rickettsia.
Membros da Banca
DOUGLAS MCINTOSH (ORIENTADOR) – UFRRJ Interno
HUARRISSON AZEVEDO SANTOS – UFRRJ Interno
MARISTELA PECKLE PEIXOTO – UFRRJ Interna
IRENE DA SILVA COELHO – UFRRJ Externa ao Programa